از جمله سمت های اسماعیل هنیه در طول های سال های گذشته می توان به موارد زیر اشاره کرد: دبیر پیشین هیئت امنای دانشگاه اسلامی غزه مسئول پیشین امور اداری دانشگاه اسلامی غزه مدیر سابق علمی دانشگاه اسلامی غزه عضو سابق منای دانشگاه اسلامی غزه عضو کمیته عالی گفتگوی حماس با بقیه گروه‌های فلسطینی و تشکیلات خودگردان عضو کمیته عالی پیگیری انتفاضه به نمایندگی از حماس رئیس دفتر شیخ احمد یاسین عضو رهبری سیاسی جنبش حماس عضو سابق هیئت مدیره جمعیت اسلامی غزه رئیس باشگاه جمعیت اسلامی غزه به مدت ۱۰ سال